Šest měsíců a dost aneb kdy zaniká povinnost zaplatit pokutu za nepodání kontrolního hlášení?

NSS rozhodl ve prospěch daňových subjektů

2.4.2025

Stalo se vám, že správce daně nestihl vydat platební výměr včas? Takový platební výměr je nezákonný a vy tak sankci nemusíte platit. Nejvyšší správní soud potvrdil, že šestiměsíční lhůta k uložení pokuty za nepodání kontrolního hlášení začíná běžet už uplynutím zákonné lhůty k jeho podání – nikoliv až po výzvě správce daně. Tento výklad zásadně mění hru ve prospěch daňových subjektů.

Autor článku: ARROWS advokátní kancelář (Mgr. Filip Ondřej, office@arws.cz, +420 245 007 740)

Jakou roli hraje termín podání? NSS stanovil pevné pravidlo

Nejvyšší správní soud (NSS) ve svém rozsudku ze dne 5. 12. 2024, č. j. 1 Afs 35/2024-43, postavil najisto klíčovou otázku – kdy začíná běžet šestiměsíční prekluzivní lhůta, po jejímž uplynutí zaniká možnost uložit pokutu za nepodání kontrolního hlášení?

Povinnost podat kontrolní hlášení vzniká plátci DPH podle zákona o dani z přidané hodnoty ve lhůtě 25 dnů po skončení kalendářního měsíce, jak plyne z ustanovení § 101e odst. 1. A právě od tohoto dne se počítá i prekluzivní šestiměsíční lhůta podle § 101i odst. 3 daně z přidané hodnoty.

Nepodáte-li hlášení včas, správce daně má přesně šest měsíců na to, aby stihl vydat platební výměr – jinak jeho šance končí z důvodu prekluze.

Zásadní výhoda? Počítání lhůty není závislé na libovůli správce daně, ale lhůta šesti měsíců se počítá od jasně stanoveného okamžiku – tedy ode dne, ve kterém došlo k porušení povinnosti.

Zákon chrání daňové subjekty před hromaděním pokut

Zákonodárce dal správci daně šest měsíců – a víc ne. Podle Nejvyššího správního soudu má tato lhůta garantovat nejen spravedlivější přístup k daňovým subjektům, ale i zabránit pozdnímu a hromadnému ukládání sankcí. Dlouhá prodleva může zničit efekt preventivního působení pokuty – a právě tomu se zákon snaží zabránit.

Správci daně tak nezbývá než reagovat v souladu se zásadou rychlosti. Tento mechanismus zvyšuje právní jistotu daňových subjektů a nutí správní orgány k větší odpovědnosti i efektivitě.

Povinnost aktivity je přitom na obou stranách. Správce daně musí sledovat zákonné lhůty a aktivně konat. Daňové subjekty pak mohou včas reagovat a hájit svá práva, pokud byla lhůta překročena.

Výzva v náhradní lhůtě?

Odvolací finanční ředitelství ve sporu tvrdilo, že počátek běhu šestiměsíční lhůty se pojí až s uplynutím náhradní lhůty k podání kontrolního hlášení podle ustanovení § 101g zákona o dani z přidané hodnoty, jak je ostatně uvedeno v metodickém pokynu generálního finančního ředitelství. NSS ale toto pojetí odmítl jako nezákonné. Pokuta se totiž vždy váže na primární povinnost podat kontrolní hlášení ve stanovené lhůtě, a výzva v náhradní lhůtě ji jen podtrhuje.

Nejvyšší správní soud připouští, že může být pro správce daně obtížné rozhodnout o povinnosti zaplatit pokutu v konkrétní výši do 6 měsíců od marného uplynutí lhůty pro podání kontrolního hlášení. Jedná se však o záměr zákonodárce, který dal přednost rychlosti a prevenci kumulace pokut za více období.

Pokud by soud přijal opačný výklad, správce daně by měl prakticky neomezený čas na to, aby vyzval plátce k doplnění hlášení podle ustanovení § 101g odst. 1 zákona o dani z přidané hodnoty – a tím i posunout počátek běhu prekluzivní lhůty, záleží totiž na správci daně, kdy vyzve daňový subjekt k doplnění kontrolního hlášení. Tento krok však nemá vliv na běh šestiměsíční prekluzivní lhůty.

Co z toho plyne pro vás?

Rozsudek Nejvyššího správního soudu přináší zásadní posun ve smyslu ochrany daňových subjektů, nyní tak

  • daňový subjekt ví s jistotou, odkdy běží šestiměsíční lhůta,
  • může namítat prekluzi, pokud správce daně nevydal pokutu včas, a
  • obecně získal daňový subjekt účinnější ochranu proti hromadění sankcí a posílenou právní jistotu.

Nejste si jisti, zda pokuty, které vám byly uloženy, skutečně obstojí? Rozhodnutí NSS ukazuje, že správce daně musí postupovat podle pravidel nastavených zákonodárcem, byť tato pravidla mohou být přísná.

Chraňte svá práva včas a efektivně. Pokud vám byla uložena pokuta za nepodané kontrolní hlášení a od marného uplynutí zákonné lhůty již uplynulo více než 6 měsíců bez vydání platebního výměru, může jít o nezákonně uloženou sankci.

Dnes je poslední den, kdy jste tenhle problém museli řešit sami!

Kontaktujte nás – prověříme zákonnost postupu správce daně a vyhodnotíme případné šance na úspěšné uplatnění námitky prekluze, rychle a efektivně.

Chcete mít jasno v daních pro OSVČ? Mgr. Kotrba si pro vás připravil webinář.

Proč si vybrat právě nás?

Naše služby využívají firmy všech velikostí, protože jim poskytujeme rychlá a efektivní řešení v oblasti smluvní dokumentace. Například:

  • Smlouvy na míru bez zbytečných průtahů: Připravíme pro vás obchodní smlouvy, dohody s dodavateli, pracovní smlouvy i další dokumenty tak, aby odpovídaly vašim potřebám a minimalizovaly rizika.
  • Jasné a srozumitelné podmínky: Navrhujeme smlouvy tak, aby byly praktické, přehledné a snadno použitelné v běžném provozu.
  • Ochrana před právními komplikacemi: Pomáháme klientům předcházet nejasnostem, sporům a nevýhodným podmínkám.

Víme, že administrativní zátěž spojená se smlouvami může brzdit váš byznys. Proto jsme pro vás připravili e-book "Advokáti radí, jak ušetřit miliony", který vám ukáže, jak mít smlouvy pod kontrolou bez zbytečných komplikací.

✅  Praktické rady, jak si efektivně nastavit smluvní procesy a ušetřit čas.
✅  Konkrétní tipy, jak se vyhnout nejčastějším chybám ve smlouvách.
Ukázku našeho přístupu: jak jednoduše a srozumitelně předáváme odborné znalosti v oblasti smluvní dokumentace.

Neztrácejte čas se smlouvami – my vám pomůžeme nastavit smluvní procesy tak, aby byly rychlé, efektivní a bezpečné.

Napište si o e-book Advokáti radí, jak ušetřit miliony ZDE 

Nechcete tenhle problém řešit sami? Věří nám více než 2000 klientů a jsme oceněni jako Právnická firma roku 2024. Podívejte se ZDE na naše reference.